Jan Čižinský se narodil 22. dubna 1978, je absolventem politologie a mezinárodních vztahů na Fakultě sociální věd Univerzity Karlovy v Praze a historie a latiny na Filozofické fakulty UK. Od roku 2003 je členem KDU-ČSL, za níž ještě jako nestraník kandidoval od roku 1998 ve všech komunálních volbách, později také ve volbách do Parlamentu ČR. Od roku 2003 působí jako pedagog na Malostranském gymnáziu, učil také na základní škole.

V roce 2007 se stal asistentem poslance, v letech 2008–2009 byl poradcem ministra a předsedy Legislativní rady vlády ČR Cyrila Svobody. Od roku 2009 působil rok jako poradce ministra pro místní rozvoj, dále jako zahraniční tajemník a v roce 2014 jako asistent poslance. V roce 2013 byl organizátorem referenda v Praze 7 za nepředraženou radnici.

V roce 2014 kandidoval za PRAHA 7 SOBĚ do zastupitelstva Prahy 7, byl zvolen a následně se stal starostou městské části. Rovněž byl zvolen zastupitelem hl. m. Prahy. Od října 2017 je poslancem za KDU-ČSL.

Jan Čižinský je ženatý a má dvě děti.